穆玄大叔在前面带路，这时一朵紫黑色的云挡住了小智他们的去路，穆玄道：“我在这里调查了五年的时间，但是最近这样紫黑色的云朵却突然增多。当现实世界产生扭曲的时候，为了保持时间与空间的平衡，会发生调节制衡的作用，就会产生这种云了。还有那种云有毒性，最好还是离远一些。”
“过去，这两个不应该相遇的时间与空间的次元曾相互碰撞，两者融合在一起。帝牙卢卡和帕路奇亚都认为彼此的领域受到了侵犯，所以就开展了一场战斗。”
就是小智他们在白杨镇的时候发生的事情。
“这个时候，时间与空间扭曲的非常严重，同时，在反转世界中就大量用处了这种紫黑色的云，骑拉帝纳对污染自己世界的帝牙卢卡和帕路奇亚十分愤怒。它在今天终于成功捕捉到了出现在现实世界中的帝牙卢卡，可是因为谢米的种子闪光让帝牙卢卡跑了。”
小智的猜测得到证实，谢米因为坏了骑拉帝纳的事情，骑拉帝纳很是生气，小智身上有帝牙卢卡和帕路奇亚赠送的东西，所以也才会被追杀。小霞道：“原因竟然是这样，难怪骑拉帝纳会这么生气了！”
谢米傲娇的扭过头，道：“它就只会生气吧！”
穆玄大叔继续道：“因为帝牙卢卡的时间之力影响，骑拉帝纳好像没有办法穿梭时空进入现实世界去了。”
谢米道：“因为它老是在生气，所以遭到天谴了吧！活该！”
小智道：“这是时间循环。现在骑拉帝纳就相当于被困在了反转世界中，所以它才会想借用谢米的种子闪光造出一个通道来，让它去报仇！但现在我们还没有妥善解决这件事情的办法，所以我们需要先回到现实世界才行。”
穆玄大叔道：“就是这个了，你们先离开这里，我还要留在反转世界调查一些事情，这个给你小智，用这个就可以联系我了！”穆玄大叔把小智、谢米和小霞推进了黑洞中。
小智点头点道：“嗯，我知道了！”
小智与小霞和谢米，通过黑洞回到了现实世界，对上的就是小刚和小光焦急的眼神。小智简单说了一下进入黑洞后的事情，一行人就带着谢米再次出发了，这次小智必须找到谢米的同伴们，来打开现实世界与反转世界的大门。
突然间一群小磁怪、三合一磁怪和自爆磁怪将小智四人包围，一个乘坐喷射器的银发青年，降落在小智四人面前。那人道：“把谢米交过来！”
谢米连连摇头：“咪不认识你！”
那人不由分说，就指挥自爆磁怪道：“自爆磁怪，使用电光！”
“火暴兽挡下来，使用喷射火焰！”
电光和喷射火焰相互碰撞，火暴兽已经进入准冠军级的实力，对付自爆磁怪这种有属性克制的宝可梦简直不在话下。小刚拿出了九尾，一同对付这群小磁怪们，那人也没有想到小智他们的宝可梦的战斗力这般强大，只是拿出了两只宝可梦就能让小磁怪它们全都失去了战斗能力。
小智等人没有打算恋战，解决完之后，就往谢米指示的方向快速跑了起来。他们乘坐上了一辆列车，小刚道：“这辆车是到哪里的？”
小智道：“反正是按照谢米的指示走的，到时候就知道了。”