朱元璋建立的这一套税收制度主要是以黄册和鱼鳞图册为主。
所谓的黄策就是人口登记册。在明太祖朱元璋时期，规定每个地方的衙门都要编制黄册，而且要把每一户的人口数以及年龄性别姓名都要登记在册。因为最后布政使司给户部的图册是以黄纸为封皮的。所以又称为黄册。这种图册主要是作为明朝征收赋税的一个根据。
鱼鳞图册实际上是一种土地登记册。朱元璋规定把全国范围内的土地划分为若干个粮区，每个粮区的土地数目以及土地的主人，面积多少都有登记在册。因为它的形状如同鱼鳞一般，所以又称为鱼鳞图册。鱼鳞图册和黄册组合成为明朝征收赋税的两个重要标准和工具。
而太祖朱元璋所建立起的这套税收制度有太多太多的毛病了，这个也许和朱元璋出身贫困有很大的关系，他不希望朝廷对百姓征太多的税，于是他把正税定得非常的低。
就拿烟草税来说，中国烟草税收始于明末。原主一直主张禁烟，后来，因为辽东战事，士兵以吸烟御寒祛病，原主在洪承畴等大臣的建议下同意施禁，采取“寓禁于征”的政策对烟草进行收税。
但这种征税不仅不够成熟，而且征收上报的税银相当的低。况且税低倒还可以接受，大不了就是惠及于民嘛，税银低了，不就说明老百姓口袋的银子就多吗？
然实际情况是，这些税不是被偷税漏税了，就是进了官吏的腰包，其中农业税占据总体税收的百分之三十左右，那么商业税方面，至少是百分之九十，国之税赋，流失如此，这是朱由检不可容忍的。
就算时至崇祯十九年，朱由检采取了些许措施，然这样的情况依然存在，只是情况稍好了些。
“蒋卿，目前朝廷虽然是入大于出，但朝廷也不能忘记税务方面还有很多乱象，譬如这商税，大明一年的商税只有区区200多万两？难道我大明的商贾都穷到这个份儿上了吗？简章是滑天下之大稽。”朱由检看完，有些怒道。
“陛下息怒。”
“息怒？朕如何息怒？崇祯十七年以前，尚可用地方官员缺额太多，法纪难伸之故来搪塞。如今大明四海升平，百姓安居乐业，税银如此之低，朕以为是不可原谅的。”朱由检顿了顿，断然道：“蒋卿，朕准备另外成立一个税务总部，专管税事。”
“税务总部？”蒋德璟震惊疑惑一句。
“正是，户部分设的十四清吏司中的税务之责，全部转入税务总部，税务总部下设渔盐司、烟草司、工商司和农业司等等，再由各司分管下面的省府县；再者减少税务名目，比如烟草司的烟草一项，朝廷在买卖上收取定额税银，其他诸多杂税一律取消。
另外，税务总部成立一支专门打击偷税漏税行为的税务营，直接隶属税务总部，其它各部没有管辖权。当然，税警总队不光是打击偷税漏税，对巧立名目、地方官员的横征暴敛，也有管辖权。”朱由检说道。
“这。。。这。。。陛下，如此一来，这户部岂不是阉割了职能？”蒋德璟有些担心道。
“卿以为何为阉割？＂朱由检反问道：＂户部职能的目的是为朝廷、为百姓更好的服务，而不是独揽大权，户部管辖范围太大，朕以为有些力不从心。朕的意思总的来说，是户部管出，税务总部只管税事，是入的职能。往后其他各部的职能亦会照此慢慢改革。”
蒋德璟听皇帝如此说，也明白皇帝这是圣意已定，再说什么也无济于事。
“其实从崇祯十八年来看，朝廷税收方面是值得肯定的，只不过这份肯定可以做的更好，蒋卿，朝廷众臣方面的工作由卿来作，不管是卿还是倪元璐或者是其他对此有异议之人，必须要全力配合，朕不想看到大规模的反对声音，明白吗？”朱由检说此话时，一股杀气溢出，让蒋德璟和唐学成一个哆嗦。
然，朱由检亦明白，如此对户部乃至内阁冲击较大，反对的臣子肯定是有的，不过是兵来将挡水来土掩罢了。