这标志着水稻基因组结构在世界面前再无秘密。
但这并不意味着研究基因组正在浪费时间。
水稻基因组测序的完成，这的确是划时代性的成果。
可惜，这也仅仅只是整个基因组学的第一步，结构基因组学。
这走出一步的确了不起，但需要我们正视而且认识的是，后面还有许多路要走。
水稻全基因组的完成图需要完善。
功能基因组学需要进一步进行探究。
“后基因组时代”已然到来，关于它的时间界定，学界有诸多争论。
不过，现在人们普遍将“DNA双螺旋结构”提出五十年之际，也就是2003年当做后基因组时代正式到来的时间。
在过去，传统水稻育种的突破主要是因为发现了例如矮杆基因、抗病基因、抗倒伏基因或者是细胞质雄性不育基因。
而功能基因组学的原理是通过对水稻基因组序列进行比较分析和多态性鉴定，从而发现了品种之间的序列差异。
序列差异对应着表型差异。那么利用这个特征，我们是否能够利用这些差异，通过分子标记技术，对5万～6万个水稻基因的功能进行注释。
这个工作能够以数百上千万计的效率完成过去在传统水稻育种研究上走过的路。
那么运用序列分析或是同源分析来查找搜寻新基因也就有了理论基础。
通过这种操作，将发现的海量新基因将开启水稻新品种选育的新纪元。
试想一下，我们是否能够借此机会，找到水稻从分化到萌芽到发育到成熟等等各个过程中的最优基因。
然后利用分子设计育种遗传工程将这些表现最好的基因导入到水稻，是否就能够制造出一种赶超“超级”的“超能”水稻。
就像是超能力，一棵水稻能够像树木一样高大一样粗壮，产出的稻谷能够像是枝头沉甸甸的果实一样丰硕。
在这种设想下，种植水稻可以像是植树造林一样。
也因此，植物基因功能组学哪怕放在十年以后，作为“后基因组计划”也绝对是植物学最前沿的领域之一。
至于功能基因组学之后的延申，蛋白质组学，既被科学技术所推动，也终受科学技术所限制。
想推进蛋白质组学，就要先发展蛋白质研究技术，但研究这个技术远比研究基因复杂。