在确认病房周围没有太多人后，小青便开始讲述起来，那是差不多两个月前的时候，她和派帕还有妮莫以及牡丹四人，偷偷潜入帕底亚巨坑。
在下面，他们遭遇了许多来自古代的宝可梦，并最终在底层的零区研究所内，从派帕的母亲……也就是发明太晶珠的奥琳博士那里，得知了由对方所制造的时光机存在。
最后他们得知真相，奥琳博士早在多年前一场事故中去世，现在的奥琳博士只是一台装载AI的机器人，并且与时光机紧密相连。
博士让他们过去的原因，就是希望他们将时光机关闭，时光机因不明原因无法关闭，不断将古代的宝可梦传送到这个时代，避免这些宝可梦离开帕底亚巨坑，博士封锁了第零区。
这种办法短期内还好，可时间一长，随着宝可梦越来越多，以及时光机的超负荷运作，已经开始不断出现问题，所以在这些古代的宝可梦开始失控前，必须要关闭时光机才行……
经过一番苦战，小青他们和故勒顿一起击败了负责守护时光机的奥琳博士AI，最终对方带着博士的愿望，通过时光机去往了古代。
随着奥琳博士的AI消失，时光机也就此关闭……嗯，按理来说应该是这样才对，可问题就发生在这里！
说到这里，小青忽然话锋一转！
“嗯？”
听到这里，鸣悠眉头轻挑。
派帕放下三明治，接过小青的话，继续说道：“恐怕时光机并不是真正的问题所在，因为……”
说着，他将一本封面有着故勒顿的书籍取出：“这是我从二手市场购买到的《朱之书》，我母亲之所以对时光机那样执着，也是小时候受到《朱之书》上面的内容影响。”
“因为某些原因，我一直都很讨厌这本书……后来为了治疗獒教父，才终于将其拾起，但依旧没有仔细研究过，直到从帕底亚巨坑回来后，我才真正开始去了解这本书的内容，想知道母亲她真正想做的事……”
所以他在从帕底亚巨坑回来后，一边钻研厨艺，一边在研究《朱之书》上那些与现实相互矛盾的问题。
就比如明明故勒顿它们是奥琳博士在发明出时光机后，从过去拉到现代的，但《朱之书》的作者海哲，早就在两百年前看到过这些宝可梦了。
没错，在那个并不存在时光机的年代……所以派帕在察觉到这一点后，猜测到一个非常惊人的真相！
那就是这些来自古代的宝可梦，可能与时光机之间，并没有太大的联系，又或者说时光机只是给了这些宝可梦，一个较为稳定的传送途径！
但他已经没办法再去帕底亚巨坑了，只能独自继续调查，最后听橘子学院有学生说，在酿光市附近出现了一只非常奇怪的班基拉斯。
于是他带着好奇来到酿光市，只可惜还没有找到铁荆棘，他就先被短信诈骗给抓进网络世界了。
虽然没过多久就成了数字生命，但进去网络世界，见到那些《朱之书》中并未记载，但却又与古代宝可梦极为相似的其他宝可梦后，他知道时光机的事情还并没有结束！
除了古代……现在就连未来的宝可梦，也一样来到了这个时代！
听到这里，小青摸着下巴，陷入沉思：“所以我们在网络世界所见到的那些宝可梦，都是来自未来？”